Все началось в 2006 году с инициативы студентов факультета мировой политики. I сессия прошла 25-27 ноября этого же года при поддержке Российской ассоциации содействия ООН и студентов МГИМО и носила факультетский характер.

II сессия Модели ООН факультета мировой политики состоялась 15-17 марта 2008 года.

Уже в 2009 году было решено провести Модель ООН университетского масштаба, и тогда она получила гордое название «Модель ООН МГУ». Было смоделировано пять органов, впервые рабочим языком Экономического и Социального Совета (ECOSOC) стал английский. После проведения конференции было принято решение, что отныне Модель будет иметь и официальное международное название - Moscow State University Model United Nations (MSUMUN). Тогда же, в 2009 году, на факультете мировой политики был создан постоянно действующий Секретариат, занимающийся подготовкой Модели.

С 2010 года в рамках Модели ООН МГУ функционируют на постоянной основе следующие органы: Совет Безопасности (СБ), Совет по правам человека (СПЧ), Экономический и социальный cовет (ECOSOC, рабочий язык - английский).

C 2014 по 2017 годы в рамках Модели ООН МГУ моделировалась работа ИМО (Международной морской организации), Совета Безопасности на испанском языке (Сonsejo de Seguridad), Совета Безопасности на китайском языке (安全理事会).

В 2016 году впервые начал функционировать комитет журналистики, который моделирует деятельность четырёх информационных агентств (BBC, CNN, Russia Today, Al Jazeera). Это стало нововведением не только для Модели ООН МГУ. Подобный опыт был первым среди всех Моделей ООН в России.

В 2018 году были открыты три новых комитета: Первый комитет Генеральной Ассамблеи, Международный суд на английском языке (International Court of Justice) и Совет Безопасности на арабском (مجلس الأمن). Таким образом, Модель ООН МГУ стала третьей Моделью в мире, работающей на всех шести официальных языках ООН. Более того, в 2018 году количество участников конференции превысило 400 человек.

В 2019 году Модель ООН МГУ снова прошла на всех шести официальных языках ООН, участие приняли 350 участников из 24 стран мира. Помимо выступлений экспертов комитетов участники имели возможность прослушать лекцию Алексея Николаевича Борисова, Первого заместителя Председателя Российской ассоциации содействия ООН и Вице-Президента Всемирной федерации ассоциаций ООН.

На протяжении следующих лет Модель ООН МГУ поддерживала высокую планку заданных стандартов. В 2021 году, несмотря на ограничения, вызванные пандемией Covid-19, Модель прошла в гибридном очно-заочном формате и привлекла несколько сотен участников. Моделируя заседания на всех шести официальных языках ООН, делегаты активно работали по самым актуальным повесткам.